Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
POTEB3A0JP26 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POTEB3A0JP26 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms