Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
A0A0U1RRA0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
A0A0U1RRA0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
A0A0U1RRA0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
A0A0U1RRA0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
A0A0U1RRA0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
A0A0U1RRA0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
A0A0U1RRA0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
A0A0U1RRA0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
A0A0U1RRA0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
A0A0U1RRA0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
A0A0U1RRA0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
A0A0U1RRA0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
A0A0U1RRA0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
A0A0U1RRA0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms