Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CTH-201ENST00000346806 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 SSX9-201ENST00000376909 591 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 VN2R17P-201ENST00000391712 832 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 NPM1P46-201ENST00000399556 865 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 GSTA10P-201ENST00000412182 576 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC016877.1-201ENST00000420417 464 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AL355516.1-201ENST00000422082 746 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AL445524.1-205ENST00000425412 392 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC097358.1-201ENST00000438827 582 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 SUMO2P10-201ENST00000452006 288 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 KDM4A-AS1-205ENST00000453015 647 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 RN7SL505P-201ENST00000482644 293 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 RN7SL388P-201ENST00000498736 339 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC146944.2-201ENST00000504546 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 CASC16-201ENST00000510238 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC139495.1-201ENST00000510264 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC006499.1-201ENST00000511870 850 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC022441.1-201ENST00000512599 794 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC044839.1-209ENST00000529769 878 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 ZNF503-AS1-205ENST00000530606 549 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC078950.1-204ENST00000540635 523 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 LINC01490-201ENST00000548705 638 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC005479.1-201ENST00000554629 451 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC078905.1-201ENST00000560803 509 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 GS1-279B7.1-201ENST00000562817 399 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 RBM4-213ENST00000578778 582 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AL132821.1-201ENST00000616029 394 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 Metazoa_SRP.192-201ENST00000616260 286 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 FTH1-212ENST00000620041 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 BCL2L11-224ENST00000639340 243 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AP000356.4-201ENST00000639500 172 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 FCGR3B-204ENST00000531221 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 KIFAP3-203ENST00000367767 2718 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC090132.1-201ENST00000524071 1480 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 ZNF430-203ENST00000595401 3021 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 KIF15-201ENST00000326047 4842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 GLRA4-201ENST00000372617 1795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC053481.2-201ENST00000602493 1815 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 PPP6C-201ENST00000373547 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC105760.1-201ENST00000244820 2231 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 EPHA4-201ENST00000281821 6346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 OR4D9-201ENST00000329328 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 IL37-203ENST00000349806 589 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 MGST3-202ENST00000367884 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 PPIH-203ENST00000372550 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 TRBV28-201ENST00000390400 364 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 IGHV1-24-201ENST00000390610 411 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 VDAC1P8-201ENST00000406025 853 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 OR4E2-201ENST00000408935 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 HLA-DQB1-AS1-201ENST00000419852 552 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 ZEB2-AS1-201ENST00000421083 453 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 CCNT2-AS1-203ENST00000428857 677 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 TRAF6P1-201ENST00000429404 1558 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 RN7SL862P-201ENST00000491550 298 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 RPL7AP2-201ENST00000496515 740 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC008638.2-201ENST00000503840 715 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 FBN2-203ENST00000507835 1884 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 LINC02162-201ENST00000512521 574 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 TRIM6-211ENST00000515022 1060 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 CCR3-208ENST00000545097 1786 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 PLA2G1B-203ENST00000549767 562 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 LINC02289-202ENST00000556781 861 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 ZNF286A-214ENST00000581529 560 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 GOSR1-212ENST00000581721 756 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 PIK3C3-204ENST00000586545 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC008770.1-206ENST00000589551 523 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 BX649601.1-201ENST00000608264 572 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AL133520.1-201ENST00000610430 700 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 PLP1-220ENST00000612423 3132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AL121583.1-201ENST00000612444 682 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AL731556.2-201ENST00000615610 770 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC073488.5-201ENST00000631993 754 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 KLF8-206ENST00000640927 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 NME8-201ENST00000199447 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 CDK15-203ENST00000434439 2240 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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