Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A3GALT2U3KPV4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A3GALT2U3KPV4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A3GALT2U3KPV4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A3GALT2U3KPV4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
A3GALT2U3KPV4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A3GALT2U3KPV4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
A3GALT2U3KPV4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
A3GALT2U3KPV4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A3GALT2U3KPV4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A3GALT2U3KPV4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A3GALT2U3KPV4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A3GALT2U3KPV4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A3GALT2U3KPV4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A3GALT2U3KPV4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms