Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms