Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms