Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALKQ9UM73 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms