Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms