Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms