Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KDM5BQ9UGL1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms