Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFIP11Q9UBB9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms