Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTTNBP2NLQ9P2B4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms