Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC88CQ9P219 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms