Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RDH8Q9NYR8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RDH8Q9NYR8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms