Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPTLC3Q9NUV7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms