Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX6

TMEM167B, Protein kish-B, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM167BQ9NRX6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM167BQ9NRX6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms