Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 SLC13A5-205ENST00000572094 986 ntTSL 523.37■■□□□ 1.337e-11■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 SLC13A5-211ENST00000575230 547 ntTSL 523.37■■□□□ 1.337e-11■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC12-210ENST00000441983 683 ntTSL 323.32■■□□□ 1.326e-6■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.933e-6■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 FBRS-208ENST00000543786 2890 ntTSL 220.43■□□□□ 0.863e-6■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC12-218ENST00000479897 454 ntTSL 319.32■□□□□ 0.686e-6■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 SLC13A5-210ENST00000574824 2506 ntTSL 219.3■□□□□ 0.687e-11■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC12-219ENST00000479955 420 ntTSL 317.92■□□□□ 0.466e-6■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 SPAG4-204ENST00000462896 368 ntTSL 316.61■□□□□ 0.256e-6■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 SPAG4-203ENST00000454819 827 ntTSL 316.57■□□□□ 0.246e-6■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC12-215ENST00000469147 1002 ntTSL 314.77□□□□□ -0.046e-6■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 COL4A5-201ENST00000328300 6483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.066e-6■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 COL4A5-202ENST00000361603 6469 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.066e-6■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC12-214ENST00000462983 543 ntTSL 414.02□□□□□ -0.176e-6■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC42.65■■■■■ 4.422e-7■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 22e-7■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 MAZ-209ENST00000565777 1313 ntTSL 225.54■■□□□ 1.682e-7■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 DAZAP1-209ENST00000590419 508 ntTSL 322.61■■□□□ 1.212e-7■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17■□□□□ 0.312e-6■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.072e-6■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.024e-7■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 HSPA9-211ENST00000512328 482 ntTSL 36.2□□□□□ -1.424e-7■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 HSPA9-202ENST00000501917 275 ntTSL 34.96□□□□□ -1.624e-7■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 CAPRIN2-205ENST00000454014 4398 ntTSL 1 (best)15.9■□□□□ 0.141e-8■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 CAPRIN2-201ENST00000298892 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.011e-8■■■□□ 18.9
DROSHAQ9NRR4 LMAN2-204ENST00000504071 562 ntTSL 227.88■■■□□ 2.059e-13■■■□□ 18.8
DROSHAQ9NRR4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.439e-13■■■□□ 18.8
DROSHAQ9NRR4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC23.07■■□□□ 1.289e-13■■■□□ 18.8
DROSHAQ9NRR4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.56■■□□□ 1.849e-7■■■□□ 18.8
DROSHAQ9NRR4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.751e-7■■■□□ 18.8
DROSHAQ9NRR4 DHCR7-209ENST00000531364 507 ntTSL 434.23■■■■□ 3.079e-7■■■□□ 18.8
DROSHAQ9NRR4 DHCR7-206ENST00000527316 1005 ntTSL 533.07■■■□□ 2.889e-7■■■□□ 18.8
DROSHAQ9NRR4 DHCR7-208ENST00000529990 525 ntTSL 432.57■■■□□ 2.89e-7■■■□□ 18.8
DROSHAQ9NRR4 DHCR7-204ENST00000525346 520 ntTSL 425.76■■□□□ 1.719e-7■■■□□ 18.8
DROSHAQ9NRR4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.589e-7■■■□□ 18.8
DROSHAQ9NRR4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.219e-7■■■□□ 18.8
DROSHAQ9NRR4 DHCR7-207ENST00000527452 579 ntTSL 422.25■■□□□ 1.159e-7■■■□□ 18.8
DROSHAQ9NRR4 RANBP1-211ENST00000448394 688 ntTSL 222.23■■□□□ 1.154e-10■■■□□ 18.8
DROSHAQ9NRR4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.282e-6■■■□□ 18.8
DROSHAQ9NRR4 SYNCRIP-203ENST00000444272 610 ntTSL 324.42■■□□□ 1.52e-12■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.122e-12■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.052e-12■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 PTBP1-217ENST00000592113 1548 ntTSL 534.34■■■■□ 3.092e-9■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 PTBP1-212ENST00000587136 583 ntTSL 332.3■■■□□ 2.762e-9■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 PTBP1-207ENST00000585932 1030 ntTSL 332.05■■■□□ 2.722e-9■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 PTBP1-208ENST00000585956 767 ntTSL 331.2■■■□□ 2.592e-9■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 RPL36-207ENST00000582463 239 ntTSL 530.85■■■□□ 2.532e-9■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 RPL36-208ENST00000590786 907 ntTSL 230.55■■■□□ 2.482e-9■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 PTBP1-219ENST00000621737 1125 ntTSL 530.25■■■□□ 2.432e-9■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 PTBP1-218ENST00000592804 742 ntTSL 229.89■■■□□ 2.372e-9■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 PTBP1-215ENST00000589883 683 ntTSL 329.88■■■□□ 2.372e-9■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.032e-9■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.92e-9■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.352e-9■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 PTBP1-205ENST00000585535 314 ntTSL 317.62■□□□□ 0.412e-9■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 RPL36-204ENST00000579446 452 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.352e-9■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 RPL36-205ENST00000579649 449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.052e-9■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.524e-8■■■□□ 18.7
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DROSHAQ9NRR4 LARP1B-210ENST00000512292 3105 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.31e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.581e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 LARP1B-209ENST00000508819 1891 ntTSL 510.32□□□□□ -0.761e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.831e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.282e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 OSMR-205ENST00000513831 766 ntTSL 316.01■□□□□ 0.152e-6■■■□□ 18.7
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DROSHAQ9NRR4 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.281e-8■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 THUMPD3-AS1-218ENST00000522525 1867 ntTSL 1 (best)6.42□□□□□ -1.381e-8■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 THUMPD3-AS1-216ENST00000521708 549 ntTSL 36.17□□□□□ -1.421e-8■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.441e-8■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 THUMPD3-AS1-201ENST00000467069 667 ntTSL 55.9□□□□□ -1.471e-8■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 THUMPD3-AS1-207ENST00000494680 544 ntTSL 55.58□□□□□ -1.521e-8■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 BTBD2-206ENST00000589200 858 ntTSL 536.05■■■■□ 3.361e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.891e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 BTBD2-208ENST00000590646 572 ntTSL 422.74■■□□□ 1.231e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 BTBD2-205ENST00000588395 352 ntTSL 521.96■■□□□ 1.111e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 BTBD2-203ENST00000587742 559 ntTSL 521.1■□□□□ 0.971e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 PISD-215ENST00000479851 655 ntTSL 331.3■■■□□ 2.61e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 KIAA0232-205ENST00000508423 700 ntTSL 233.04■■■□□ 2.882e-7■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 DOT1L-202ENST00000446286 376 ntTSL 325.57■■□□□ 1.688e-8■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.882e-7■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.982e-7■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 KIAA0232-204ENST00000503278 563 ntTSL 45.02□□□□□ -1.612e-7■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-223ENST00000589266 616 ntTSL 338.28■■■■□ 3.725e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.345e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-231ENST00000591097 1507 ntTSL 1 (best)35.87■■■■□ 3.335e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-219ENST00000588411 619 ntTSL 533.46■■■□□ 2.955e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-208ENST00000586548 1734 ntTSL 333.42■■■□□ 2.945e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-205ENST00000585913 833 ntTSL 333.25■■■□□ 2.915e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.855e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-229ENST00000590704 1456 ntTSL 232.42■■■□□ 2.785e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-224ENST00000589686 532 ntTSL 232.22■■■□□ 2.755e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.665e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-226ENST00000590171 905 ntTSL 331.66■■■□□ 2.665e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-234ENST00000591659 587 ntTSL 231.66■■■□□ 2.665e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.635e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.635e-6■■■□□ 18.7
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