Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCL28Q9NRJ3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL28Q9NRJ3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL28Q9NRJ3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL28Q9NRJ3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL28Q9NRJ3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL28Q9NRJ3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL28Q9NRJ3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL28Q9NRJ3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL28Q9NRJ3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL28Q9NRJ3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL28Q9NRJ3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL28Q9NRJ3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL28Q9NRJ3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL28Q9NRJ3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL28Q9NRJ3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL28Q9NRJ3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL28Q9NRJ3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCL28Q9NRJ3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms