Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W1

MS4A6A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6A, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6AQ9H2W1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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MS4A6AQ9H2W1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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MS4A6AQ9H2W1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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MS4A6AQ9H2W1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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MS4A6AQ9H2W1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A6AQ9H2W1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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