Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms