Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBDC1Q9BVG4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms