Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKNK1Q9BUB5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKNK1Q9BUB5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms