Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C16orf70Q9BSU1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C16orf70Q9BSU1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C16orf70Q9BSU1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C16orf70Q9BSU1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C16orf70Q9BSU1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C16orf70Q9BSU1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C16orf70Q9BSU1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C16orf70Q9BSU1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C16orf70Q9BSU1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C16orf70Q9BSU1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C16orf70Q9BSU1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C16orf70Q9BSU1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C16orf70Q9BSU1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C16orf70Q9BSU1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
C16orf70Q9BSU1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C16orf70Q9BSU1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C16orf70Q9BSU1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C16orf70Q9BSU1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C16orf70Q9BSU1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms