Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD1Q99460 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD1Q99460 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms