Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R9BQ96SB3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms