Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SAMD11Q96NU1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms