Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCLT1Q96NL6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms