Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 TGFBI-203ENST00000504185 561 ntTSL 415.79■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TINAGL1-208ENST00000480586 926 ntTSL 215.79■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ERC1-205ENST00000440394 7040 ntTSL 1 (best)15.73■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SP4-202ENST00000432066 377 ntTSL 515.72■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC31A2-203ENST00000490809 771 ntTSL 215.71■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 EPHB4-206ENST00000487222 5058 ntTSL 1 (best)15.71■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.115e-12■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CMC2-222ENST00000570086 801 ntTSL 315.69■□□□□ 0.15e-12■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.15e-12■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SUCLG2-202ENST00000460567 1596 ntTSL 1 (best)15.69■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BAP1-209ENST00000490804 870 ntTSL 215.67■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NR1H3-205ENST00000412937 574 ntTSL 415.66■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ARFGAP2-209ENST00000526185 1723 ntTSL 215.65■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 YTHDF3-203ENST00000519428 676 ntTSL 215.62■□□□□ 0.095e-12■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DMTN-221ENST00000523300 601 ntTSL 415.61■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NUDT9-205ENST00000512216 690 ntTSL 315.6■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SH3BP2-206ENST00000503219 551 ntTSL 415.6■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ATP5C1-206ENST00000465936 292 ntTSL 315.59■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLCD3-210ENST00000615898 288 ntTSL 315.53■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ENTPD6-208ENST00000427553 451 ntTSL 315.53■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KANSL1-230ENST00000639805 557 ntTSL 415.53■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 WDR18-201ENST00000251289 1501 ntTSL 515.53■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BAG6-245ENST00000437771 2407 ntTSL 515.52■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TAPBPL-208ENST00000545700 2344 ntTSL 215.49■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MYO18A-206ENST00000529889 698 ntTSL 215.48■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RARRES2-203ENST00000467793 583 ntTSL 315.48■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TXLNGY-206ENST00000459719 2098 ntTSL 215.48■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.075e-12■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MON1B-206ENST00000564006 948 ntTSL 215.45■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PDCD6-203ENST00000505526 1484 ntTSL 1 (best)15.44■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.064e-7■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PML-213ENST00000565239 783 ntTSL 315.37■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 REV3L-205ENST00000422377 10964 ntTSL 215.34■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SH3BP2-219ENST00000511237 517 ntTSL 515.34■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SH3BP2-215ENST00000510074 649 ntTSL 515.34■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MRPS28-204ENST00000519120 403 ntTSL 215.32■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ARFGAP2-204ENST00000524727 995 ntTSL 215.31■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.044e-7■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PHF20L1-208ENST00000395383 3229 ntTSL 515.28■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC19A1-205ENST00000443742 777 ntTSL 315.28■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAB40C-202ENST00000509637 565 ntTSL 315.28■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TCHP-204ENST00000537218 853 ntTSL 215.28■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 POLR1C-207ENST00000481352 1725 ntTSL 515.26■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC4A7-208ENST00000437266 3407 ntTSL 1 (best)15.21■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DCUN1D5-202ENST00000525420 651 ntTSL 315.2■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SH3BP2-211ENST00000506932 537 ntTSL 415.2■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 WDR18-208ENST00000591276 607 ntTSL 315.2■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BTBD19-206ENST00000482715 558 ntTSL 415.13■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NDUFC1-207ENST00000507764 838 ntTSL 215.11■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TCEA2-206ENST00000440819 1083 ntTSL 515.11■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 54.9
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