RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506932.1

SH3BP2-211, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-211ENST00000506932 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.89■■■■□ 3.82
SH3BP2-211ENST00000506932 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.76■■■■□ 3.15
SH3BP2-211ENST00000506932 ABCC9O60706 1549 aa34.44■■■■□ 3.1
SH3BP2-211ENST00000506932 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.88■■■□□ 2.85
SH3BP2-211ENST00000506932 NACADO15069 1562 aa32.73■■■□□ 2.83
SH3BP2-211ENST00000506932 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.63■■■□□ 2.81
SH3BP2-211ENST00000506932 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.36■■■□□ 2.77
SH3BP2-211ENST00000506932 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
SH3BP2-211ENST00000506932 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.26■■■□□ 2.75
SH3BP2-211ENST00000506932 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.1■■■□□ 2.73
SH3BP2-211ENST00000506932 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.09■■■□□ 2.73
SH3BP2-211ENST00000506932 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.98■■■□□ 2.71
SH3BP2-211ENST00000506932 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.97■■■□□ 2.71
SH3BP2-211ENST00000506932 SCRIBQ14160 1630 aa31.76■■■□□ 2.67
SH3BP2-211ENST00000506932 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.46■■■□□ 2.63
SH3BP2-211ENST00000506932 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
SH3BP2-211ENST00000506932 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.13■■■□□ 2.57
SH3BP2-211ENST00000506932 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.95■■■□□ 2.54
SH3BP2-211ENST00000506932 SMARCA4P51532 1647 aa30.3■■■□□ 2.44
SH3BP2-211ENST00000506932 NCAPD3P42695 1498 aa30.2■■■□□ 2.43
SH3BP2-211ENST00000506932 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.19■■■□□ 2.42
SH3BP2-211ENST00000506932 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
SH3BP2-211ENST00000506932 SMARCA2P51531 1590 aa30.11■■■□□ 2.41
SH3BP2-211ENST00000506932 HMGXB3Q12766 1538 aa30.05■■■□□ 2.4
SH3BP2-211ENST00000506932 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.02■■■□□ 2.4
SH3BP2-211ENST00000506932 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.97■■■□□ 2.39
SH3BP2-211ENST00000506932 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-211ENST00000506932 NESP48681 1621 aa29.71■■■□□ 2.35
SH3BP2-211ENST00000506932 WIZO95785 1651 aa29.7■■■□□ 2.35
SH3BP2-211ENST00000506932 ERCC6Q03468 1493 aa29.65■■■□□ 2.34
SH3BP2-211ENST00000506932 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
SH3BP2-211ENST00000506932 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.48■■■□□ 2.31
SH3BP2-211ENST00000506932 CUX2O14529 1486 aa29.45■■■□□ 2.31
SH3BP2-211ENST00000506932 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.37■■■□□ 2.29
SH3BP2-211ENST00000506932 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
SH3BP2-211ENST00000506932 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
SH3BP2-211ENST00000506932 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.29■■■□□ 2.28
SH3BP2-211ENST00000506932 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.25■■■□□ 2.27
SH3BP2-211ENST00000506932 CFTRP13569 1480 aa29.06■■■□□ 2.24
SH3BP2-211ENST00000506932 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.04■■■□□ 2.24
SH3BP2-211ENST00000506932 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29■■■□□ 2.23
SH3BP2-211ENST00000506932 CEP164Q9UPV0 1460 aa29■■■□□ 2.23
SH3BP2-211ENST00000506932 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29■■■□□ 2.23
SH3BP2-211ENST00000506932 WDR62O43379 1518 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-211ENST00000506932 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.96■■■□□ 2.23
SH3BP2-211ENST00000506932 PRDM2Q13029 1718 aa28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-211ENST00000506932 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
SH3BP2-211ENST00000506932 TOPBP1Q92547 1522 aa28.51■■■□□ 2.15
SH3BP2-211ENST00000506932 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
SH3BP2-211ENST00000506932 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.44■■■□□ 2.14
SH3BP2-211ENST00000506932 IFT140Q96RY7 1462 aa28.39■■■□□ 2.13
SH3BP2-211ENST00000506932 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
SH3BP2-211ENST00000506932 ABCC8Q09428 1581 aa28.37■■■□□ 2.13
SH3BP2-211ENST00000506932 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
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SH3BP2-211ENST00000506932 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
SH3BP2-211ENST00000506932 CUX1P39880 1505 aa28.18■■■□□ 2.1
SH3BP2-211ENST00000506932 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.16■■■□□ 2.1
SH3BP2-211ENST00000506932 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.09
SH3BP2-211ENST00000506932 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.14■■■□□ 2.09
SH3BP2-211ENST00000506932 OSCARQ8IYS5 282 aa28.12■■■□□ 2.09
SH3BP2-211ENST00000506932 SOGA1O94964 1423 aa28.08■■■□□ 2.09
SH3BP2-211ENST00000506932 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
SH3BP2-211ENST00000506932 CHD1O14646 1710 aa27.99■■■□□ 2.07
SH3BP2-211ENST00000506932 WDR97A6NE52 1622 aa27.96■■■□□ 2.07
SH3BP2-211ENST00000506932 TRIM41Q8WV44 630 aa27.94■■■□□ 2.06
SH3BP2-211ENST00000506932 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.87■■■□□ 2.05
SH3BP2-211ENST00000506932 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.85■■■□□ 2.05
SH3BP2-211ENST00000506932 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.85■■■□□ 2.05
SH3BP2-211ENST00000506932 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.85■■■□□ 2.05
SH3BP2-211ENST00000506932 SYNJ1O43426 1573 aa27.84■■■□□ 2.05
SH3BP2-211ENST00000506932 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.82■■■□□ 2.04
SH3BP2-211ENST00000506932 FBLN2P98095 1184 aa27.82■■■□□ 2.04
SH3BP2-211ENST00000506932 TOP2BQ02880 1626 aa27.81■■■□□ 2.04
SH3BP2-211ENST00000506932 PBRM1Q86U86 1689 aa27.81■■■□□ 2.04
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SH3BP2-211ENST00000506932 GRIN2BQ13224 1484 aa27.8■■■□□ 2.04
SH3BP2-211ENST00000506932 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.79■■■□□ 2.04
SH3BP2-211ENST00000506932 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.78■■■□□ 2.04
SH3BP2-211ENST00000506932 ARHGEF11O15085 1522 aa27.77■■■□□ 2.04
SH3BP2-211ENST00000506932 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.76■■■□□ 2.04
SH3BP2-211ENST00000506932 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
SH3BP2-211ENST00000506932 SYNJ2O15056 1496 aa27.68■■■□□ 2.02
SH3BP2-211ENST00000506932 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
SH3BP2-211ENST00000506932 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.64■■■□□ 2.02
SH3BP2-211ENST00000506932 ADAMTS12P58397 1594 aa27.55■■■□□ 2
SH3BP2-211ENST00000506932 ARAP1Q96P48 1450 aa27.54■■■□□ 2
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SH3BP2-211ENST00000506932 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.45■■□□□ 1.98
SH3BP2-211ENST00000506932 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP2-211ENST00000506932 CEP170Q5SW79 1584 aa27.4■■□□□ 1.98
SH3BP2-211ENST00000506932 NUP160Q12769 1436 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP2-211ENST00000506932 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.29■■□□□ 1.96
SH3BP2-211ENST00000506932 SHROOM2Q13796 1616 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-211ENST00000506932 KIF27Q86VH2 1401 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-211ENST00000506932 IGF1RP08069 1367 aa27.17■■□□□ 1.94
SH3BP2-211ENST00000506932 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.16■■□□□ 1.94
SH3BP2-211ENST00000506932 CUL7Q14999 1698 aa27.14■■□□□ 1.94
SH3BP2-211ENST00000506932 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
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