Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRIM41Q8WV44 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms