Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC44

RETREG2, Reticulophagy regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG2Q8NC44 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms