Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF38AQ8NAV1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms