Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC2Q8N158 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms