Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLX4Q8IY92 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLX4Q8IY92 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms