Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3BQ7Z3V4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms