Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PTF1AQ7RTS3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTF1AQ7RTS3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms