Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
LRRC9Q6ZRR7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LRRC9Q6ZRR7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
LRRC9Q6ZRR7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
LRRC9Q6ZRR7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LRRC9Q6ZRR7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LRRC9Q6ZRR7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LRRC9Q6ZRR7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRC9Q6ZRR7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRC9Q6ZRR7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRC9Q6ZRR7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRC9Q6ZRR7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRC9Q6ZRR7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRC9Q6ZRR7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRC9Q6ZRR7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRC9Q6ZRR7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRC9Q6ZRR7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
LRRC9Q6ZRR7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LRRC9Q6ZRR7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LRRC9Q6ZRR7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
LRRC9Q6ZRR7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
LRRC9Q6ZRR7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
LRRC9Q6ZRR7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
LRRC9Q6ZRR7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LRRC9Q6ZRR7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
LRRC9Q6ZRR7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms