Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNI2Q6ZMN8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms