Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00575Q6W349 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms