Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF38BQ5VTL8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms