Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCID2Q5JVF3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCID2Q5JVF3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms