Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF6

HSP90AB4P, Putative heat shock protein HSP 90-beta 4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB4PQ58FF6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB4PQ58FF6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB4PQ58FF6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB4PQ58FF6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB4PQ58FF6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB4PQ58FF6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB4PQ58FF6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB4PQ58FF6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB4PQ58FF6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB4PQ58FF6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB4PQ58FF6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB4PQ58FF6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB4PQ58FF6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB4PQ58FF6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB4PQ58FF6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB4PQ58FF6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB4PQ58FF6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms