Protein–RNA interactions for Protein: Q52M75

LINC01554, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01554, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01554Q52M75 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC01554Q52M75 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms