Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED5Q49AG3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZBED5Q49AG3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZBED5Q49AG3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZBED5Q49AG3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZBED5Q49AG3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZBED5Q49AG3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZBED5Q49AG3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZBED5Q49AG3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZBED5Q49AG3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED5Q49AG3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED5Q49AG3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED5Q49AG3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED5Q49AG3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED5Q49AG3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED5Q49AG3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED5Q49AG3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED5Q49AG3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms