Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms