Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC18A3Q16572 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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