Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PSMD5Q16401 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD5Q16401 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms