Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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ZFHX3Q15911 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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