Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USF2Q15853 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USF2Q15853 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USF2Q15853 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
USF2Q15853 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
USF2Q15853 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
USF2Q15853 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
USF2Q15853 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
USF2Q15853 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
USF2Q15853 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USF2Q15853 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms