Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SMCO1Q147U7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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